Organizacja pierwszego pomieszczenia typu Clean-room w CBK PAN rozpoczęła się przed 2000 rokiem, natomiast ostatnia modernizacja skończyła się 2022 roku. Całkowita powierzchnia pomieszczenia to 90m2. Czystość utrzymywana jest na poziomie lepszym/równym ISO7. Kontrolę czystości przeprowadza się cyklicznie, z możliwością dodatkowej kontroli na życzenie. Temperatura kontrolowana i utrzymywana jest na poziomie 22oC +/-3oC; wilgotność kontrolowana i utrzymywana jest na poziomie 50%, +/-10%.
Clean-room w CBK PAN jest pomieszczeniem typu EPA (ESD Protected Area).